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Infección - Patógeno con ciclo vital propio

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La infección es la invasión del organismo por un patógeno (bacteria, virus, hongo, parásito) con ciclo vital propio e independiente del huésped. El modelo SIR describe la dinámica epidémica poblacional: el número reproductivo básico R = / determina si la infección se propaga (R > 1) o se extingue (R < 1). La vacunación reduce la fracción susceptible S hasta que R_efec = R·S/N < 1 (inmunidad de grupo).

El modelo within-host de Perelson describe la dinámica de la infección dentro del paciente: las células diana (T: hepatocitos en hepatitis B, linfocitos CD4 en VIH) son infectadas por el virus (_v), producen viriones (p) que son aclarados (c). En ausencia de tratamiento, el VIH tiene R within-host 810: sin tratamiento antirretroviral, la replicación viral destruye los CD4 de forma inexorable. Los antivirales reducen p (inhibidores de proteasa) o _v (inhibidores de integrasa/transcriptasa).

La cinética de destrucción bacteriana por neutrófilos sigue Michaelis-Menten: a bajas concentraciones bacterianas (B << K_sat), el killing es lineal en B (destrucción eficiente); a altas concentraciones (B >> K_sat), el killing se satura (los neutrófilos están 'desbordados'). En pacientes neutropénicos (N < 500 células/mL), k_kill·N es tan bajo que incluso bacteriemias de baja densidad pueden progresar a sepsis.

La actividad bactericida del antibiótico se rige por parámetros PK-PD específicos del mecanismo de acción: -lactámicos (tiempo dependiente: eficacia cuando t > MIC es el mayor porcentaje del intervalo); aminoglucósidos y fluoroquinolonas (concentración dependiente: la razón C_max/MIC o AUC/MIC es el parámetro predictor). La optimización PK-PD guía la dosificación para maximizar el efecto bactericida y minimizar la resistencia emergente.

La sepsis es la respuesta inflamatoria sistémica descontrolada a la infección: los mediadores inflamatorios (IL-6, TNF, IL-1) superan el umbral M_thresh disfunción endotelial coagulopatía fallo multiorgánico (D_org 1). El score SOFA (Sequential Organ Failure Assessment) cuantifica D_org para 6 sistemas (respiratorio, coagulación, hígado, cardiovascular, SNC, renal). Un SOFA score 2 define sepsis; shock séptico añade hipotensión refractaria + lactato > 2 mmol/L.

>Modelo

ID:('ky', 53)


SIR susceptibles

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$\frac{dS}{dt}=-\beta SI$

$I$
Infectados
$pers$
$S$
Susceptibles
$pers$
$\beta$
Transmisión
$1/pers·s$



>Modelo

ID:('gm', 502)


SIR infectados

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$\frac{dI}{dt}=\beta SI-\gamma I$

$I$
Infectados
$pers$
$S$
Susceptibles
$pers$
$gamma$
Recuperación
$1/s$
$\beta$
Transmisión
$1/pers·s$



>Modelo

ID:('gm', 503)


SIR removidos

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$\frac{dR}{dt}=\gamma I$

$I$
Infectados
$pers$
$gamma$
Recuperación
$1/s$



>Modelo

ID:('gm', 504)


Número reproductivo

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$R_0=\frac{\beta N_{pop}}{\gamma}$

$N_{pop}$
Población
$pers$
$gamma$
Recuperación
$1/s$
$\beta$
Transmisión
$1/pers·s$



>Modelo

ID:('gm', 505)


Reproductivo efectivo

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$R_{eff}=R_0S/N_{pop}$

$N_{pop}$
Población
$pers$
$S$
Susceptibles
$pers$



>Modelo

ID:('gm', 506)


Perelson T

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$\frac{dT}{dt}=s_T-d_TT-\beta_vTV$

$\beta_v$
Infección viral
$m³/virion·s$
$T$
Células diana
$cell/m³$
$V$
Viriones
$virion/m³$
$s_T$
Producción células diana
$cell/m³s$
$d_T$
Muerte células diana
$1/s$



>Modelo

ID:('gm', 507)


Perelson I

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$\frac{dI_w}{dt}=\beta_vTV-\delta_II_w$

$\beta_v$
Infección viral
$m³/virion·s$
$T$
Células diana
$cell/m³$
$I_w$
Células infectadas
$cell/m³$
$V$
Viriones
$virion/m³$
$delta_I$
Muerte infectadas
$1/s$



>Modelo

ID:('gm', 508)


Perelson V

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$\frac{dV}{dt}=p_vI_w-c_VV$

$I_w$
Células infectadas
$cell/m³$
$V$
Viriones
$virion/m³$
$c_V$
Clearance viral
$1/s$
$p_v$
Producción viral
$virion/cell·s$



>Modelo

ID:('gm', 509)


Duplicación

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$T_{dup}=\frac{\ln2}{k_{rep}}$

$k_{rep}$
Replicación bacteriana
$1/s$



>Modelo

ID:('gm', 510)


Bacterias

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$\frac{dB}{dt}=k_{rep}B-\frac{k_{kill}N_{neut}B}{K_{sat}+B}-E_{kill}B$

$B$
Bacterias
$bacteria/m³$
$N_{neut}$
Neutrófilos
$cell/m³$
$K_{sat}$
Saturación bacteriana
$bacteria/m³$
$E_{kill}$
Efecto bactericida
$1/s$
$k_{rep}$
Replicación bacteriana
$1/s$
$k_{kill}$
Killing neutrófilos
$m³/cell·s$



>Modelo

ID:('gm', 511)


PK bicompartimental

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$C=A_{pk}e^{-\alpha_{pk}t}+B_{pk}e^{-\beta_{pk}t}$

$alpha_{pk}$
Fase alfa PK
$1/s$
$\beta_{pk}$
Fase beta PK
$1/s$
$A_{pk}$
Amplitude A PK
$mol/m³$
$B_{pk}$
Amplitude B PK
$mol/m³$
$C$
Concentración antibiótico
$mol/m³$
$t$
Tiempo
$s$



>Modelo

ID:('gm', 512)


AUC

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$AUC=\frac{Dose,F_{abs}}{Cl_{total}}$

$AUC$
Área bajo la curva
$mol·s/m³$



>Modelo

ID:('gm', 513)


PK-PD Hill

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$E_{kill}=\frac{E_{max}(AUC/MIC)^{n_{Hill}}}{(AUC/MIC)^{n_{Hill}}+(AUC_{50}/MIC)^{n_{Hill}}}$

$E_{kill}$
Efecto bactericida
$1/s$



>Modelo

ID:('gm', 514)


Mediador inflamatorio

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$\frac{dM_{inf}}{dt}=k_M,inflammationGain,pathogenSignal-k_{M,clear}M_{inf}$

$M_{inf}$
Mediador inflamatorio
$1$



>Modelo

ID:('gm', 515)


Disfunción orgánica

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$\frac{dD_{org}}{dt}=k_D\max(M_{inf}-M_{thresh},0)(1-D_{org})$

$D_{org}$
Disfunción orgánica
$1$
$M_{inf}$
Mediador inflamatorio
$1$



>Modelo

ID:('gm', 516)


Estructura del modelo

Descripción

Red de modelo


Primero, seleccione la ecuación:   a ,  luego, seleccione la variable:   a 

Símbolo
Ecuación
Resuelto
Traducido

Cálculos

Símbolo
Ecuación
Resuelto
Traducido

 Variable   Dado   Calcule   Objetivo :   Ecuación   A utilizar



Variables

Símbolo
Texto
Variable
Valor
Unidades
Calcule
Valor MKS
Unidades MKS
$D_{org}$
D_org
Disfunción orgánica
1
$\beta_v$
beta_v
Infección viral
m³/virion·s
$I$
I
Infectados
pers
$M_{inf}$
M_inf
Mediador inflamatorio
1
$N_{pop}$
N_pop
Población
pers
$S$
S
Susceptibles
pers
$B$
B
Bacterias
bacteria/m³
$T$
T
Células diana
cell/m³
$I_w$
Iw
Células infectadas
cell/m³
$N_{neut}$
N_neut
Neutrófilos
cell/m³
$K_{sat}$
K_sat
Saturación bacteriana
bacteria/m³
$V$
V
Viriones
virion/m³
$s_T$
s_T
Producción células diana
cell/m³s
$c_V$
c_V
Clearance viral
1/s
$E_{kill}$
E_kill
Efecto bactericida
1/s
$alpha_{pk}$
alpha_pk
Fase alfa PK
1/s
$\beta_{pk}$
beta_pk
Fase beta PK
1/s
$d_T$
d_T
Muerte células diana
1/s
$delta_I$
delta_I
Muerte infectadas
1/s
$p_v$
p_v
Producción viral
virion/cell·s
$gamma$
gamma
Recuperación
1/s
$k_{rep}$
k_rep
Replicación bacteriana
1/s
$\beta$
beta
Transmisión
1/pers·s
$k_{kill}$
k_kill
Killing neutrófilos
m³/cell·s
$A_{pk}$
A_pk
Amplitude A PK
mol/m³
$B_{pk}$
B_pk
Amplitude B PK
mol/m³
$C$
C
Concentración antibiótico
mol/m³
$AUC$
AUC
Área bajo la curva
mol·s/m³
$t$
t
Tiempo
s

ID:(0, 53)


gphysics.net - Dr. Willy H. Gerber
Palos Verdes, Costa de Corral, Región de los Rios, Chile